- Szerkezet
- kromatin
- A hiszton oktamer
- Euchromatin és heterochromatin
- Az euchromatin funkciói
- Miért?
- Irodalom
Az euchromatin az eukarióta kromoszómák azon része, amely enyhén csomagolt kromatinból áll, és sok szervezet genomjának kódoló génszekvenciáit tartalmazza.
Az eukarióta kromoszómák e régiója transzkripciósan aktív területekkel van kapcsolatban, ezért ez rendkívül fontos a szervezet sejtjeiben. Ez egyértelműen látható azokban a sejtekben, amelyek nem osztódnak, mivel kondenzációkor vagy tömörítéskor heterochromatinná válik, a mitotikus és / vagy meiotikus sejtosztódást megelőző lépésben.
Az euchromatin hozzáférhető a transzkripciós gépekhez (Forrás: Wenqiang Shi a Wikimedia Commons segítségével)
Tehát az euchromatin a kromatin szerkezeti felépítésének két típusa közül az egyik, a második heterochromatin, amely lehet fakultatív vagy konstitutív.
Szerkezet
Az euchromatin szerkezete pontosan leírható, mint a sok tankönyvben található kromatin szerkezete, mivel az utóbbi és a heterochromatin közötti kevés különbség egyike a DNS + protein szál tömörítésének vagy kondenzációjának a szintje.
kromatin
Az eukarióta organizmusok DNS-e megtalálható a magban, szoros kapcsolatban sok nagyszámú fehérjével. Ezek közül a fehérjék közül néhány kiemelkedő jelentőséggel bír, hisztonok, amelyek felelősek a kromoszómális DNS-szálak "szervezéséért" és kondenzálásáért, lehetővé téve ezeknek a nagy molekuláknak egy ilyen kis térben "belépését" és a gének expressziójának ellenőrzését.
Minden eukarióta kromoszóma egyetlen DNS-szálból és nagy számú hisztonfehérjéből áll. Ezek a struktúrák szignifikánsan dinamikusak, mivel a tömörítés mértéke nemcsak a sejtek transzkripciós igényeitől függ, hanem a sejtciklus pillanatától és néhány környezeti jeltől függően is módosul.
A kromatin tömörítésében bekövetkező változások egy vagy másik módon befolyásolják a genetikai expresszió szintjét (egyes régiókban több, mint másokban), tehát megfelel az információ epigenetikus szabályozásának szintjének.
A hisztonok lehetővé teszik, hogy az egyes kromoszómák DNS-szálának hossza közel 50-szer lerövidüljön, ami különösen fontos a sejtosztódás során, mivel a kromatin tömörítés biztosítja a kromoszómák helyes szétválasztását a lányos sejtek között.
A hiszton oktamer
Az eukarióta kromoszómák DNS-molekulái egy "hengeres" szerkezetet vesznek körül, amely nyolc hisztonfehérjéből áll: H2A, H2B, H3 és H4. Az oktamer atommag H2A és H2B két dimerjéből, valamint a H3 és H4 fehérjék tetrameréből áll.
A hisztonok bázikus fehérjék, mivel nagyszámú pozitív töltésű aminosavmaradékot tartalmaznak, például például a lizint és az arginint. Ezek a pozitív töltések elektrosztatikusan kölcsönhatásba lépnek a DNS-molekulák negatív töltésével, elősegítve a fehérjemaggal való egyesülését.
Mindegyik hiszton-oktamer körülbelül 146 bázispárt tekercsel, és így nukleoszómát alkot. A kromatin egymást követő nukleoszómákból áll, amelyeket egy rövid DNS-darab és a H1 nevű hiszton-áthidaló vagy kapcsolódási fehérje kapcsol össze. Ez a konfiguráció a kezdeti hosszhoz képest 7-szer csökken a DNS hosszát.
A hisztonfehérjéknek olyan aminosav-„farok” is vannak, amelyek kinyúlnak a nukleoszómákból, és amelyek kovalens módosításokon mennek keresztül, amelyek módosíthatják a kromatin tömörítés szintjét (a tömörítést a DNS kovalens módosítása, például a, citokin-metilezés, amely elősegíti a tömörítést).
Az egyes sejtek élettartamától függően a nukleoszómákból álló szál tovább kompaktálódhat, kialakítva egy „30 nm-es rostnak” nevezett rostos szerkezetet, amely további 7-szer lerövidíti a DNS-molekula hosszát.
Ezt a 30 nm-es szálat a mag belsejében radiális hurok formájában lehet megszervezni; ezeket a hurkokat transzkripciósan aktív gének hordozzák, amelyek megfelelnek az euchromatinnak.
Euchromatin és heterochromatin
Az euchromatin és a heterochromatin a kromatin szervezet két típusa. A heterochromatin a kromoszóma legrövidebb vagy lezárt része; a hypoacetilezés és a hipermetiláció biokémiai jelei jellemzik (magasabb eukariótákban a H3 hiszton 9. maradék metilezése).
A heterochromatinnal kapcsolatban transzkripciósan csendes genomi régiók, ismétlődő szekvenciák régiói és transzposztatív elemek és retrotranszpononok inváziójának "vestigiális" régiói, néhányat említve.
A kromatin szervezettsége a magban (Forrás: Sha, K. és Boyer, LA) A pluripotens sejtek kromatin aláírása (2009. május 31.), StemBook, szerk. 1.45.1, http://www.stembook.org. Via Wikimedia Commons)
A heterochromatin a kromoszómák telomer és centromer régióit állítja össze, amelyek funkcionálisan fontosak ezeknek a struktúráknak a végén és a sejtosztódási események során történő megfelelő szegregációjában.
Ezen túlmenően, a sejt transzkripciós igényeitől függően, a kromatin egy része heterochromatint hozhat létre egy időben, és egy másik engedheti el ezt a tömörítést.
Az euchromatint ezzel szemben hiperacetiláció és hipometiláció jellemzi, pontosabban az acetilcsoport "jelölése" a H3 és H4 hisztonok 4. lizinmaradékánál.
Ez megfelel a kromatin "lazább" régióinak, és általában a legtöbb transzkripciós aktív részt képviseli, vagyis ahol a legtöbb kódoló gént csoportosítják.
Az euchromatin funkciói
Az euchromatin nagyon bőséges a sejtmagban, amikor a sejtek nem osztódnak, azaz amikor a kromoszómák nem kondenzálódnak és nem mutatják jellegzetes alakjukat.
Tekintettel arra, hogy a kromatinnak ez a része tartalmazza a legtöbb transzkripciósan aktív gént, az euchromatin fontos funkciókat tölt be a fejlődésben, valamint az anyagcserében, a fiziológiában és a sejtekben rejlő létfontosságú biológiai folyamatok szabályozásában.
Miért?
Mivel az „aktív” gének az összes fehérjét és enzimet kódolják, amelyek a sejt összes anyagcsere- és élettani folyamatának elvégzéséhez szükségesek.
Azok a gének, amelyek nem kódolják a fehérjéket, de a transzkripció szempontjából is aktívak, általában szabályozó funkcióval rendelkeznek, vagyis kis RNS molekulákat kódolnak, transzkripciós faktorokat, riboszomális RNS-ket stb.
Ezért a transzkripciós folyamatok szabályozása az euchromatinban található információtól, valamint a sejtosztódással és szaporodással kapcsolatos folyamatok szabályozásától is függ.
Irodalom
- Brooker, R., Widmaier, E., Graham, L., Stiling, P., Hasenkampf, C., Hunter, F.,… és Riggs, D. (2010). Biológia.
- Eissenberg, J., Elgin, S. (2005), Heterochromatin and Euchromatin. Élettudományi Enciklopédia. John Wiley & Sons, Ltd.
- Griffiths, AJ, Wessler, SR, Lewontin, RC, Gelbart, WM, Suzuki, DT és Miller, JH (2005). Bevezetés a genetikai elemzésbe. Macmillan.
- Grunstein, M., Hecht, A., Fisher-Adams, G., Wan, J., Mann, RK, Strahl-Bolsinger, S.,… & Gasser, S. (1995). Az euchromatin és a heterochromatin szabályozása hisztonok segítségével az élesztőben. J Cell Sci, 1995 (19. kiegészítés), 29-36.
- Tamaru, H. (2010). Az euchromatin / heterochromatin terület korlátozása: a jumonji keresztezi a vonalat. Gének és fejlődés, 24 (14), 1465-1478.