- A kromoszómás duplikációk mechanizmusa
- Kromoszómás duplikációk a gének evolúciójában
- Kromoszómás duplikációk a fajok fejlődésében
- A mikroduplációk által az egyénben okozott problémák
- Irodalom
A kromoszómális sokszorosítás a DNS egy olyan frakcióját írja le, amely kétszer jelenik meg genetikai rekombináció termékeként. A kromoszómás duplikáció, géndupláció vagy amplifikáció az élőlények variabilitásának és evolúciójának egyik forrása.
A kromoszómális sokszorosítás egyfajta mutáció, mivel magában foglalja a kromoszómális régióban a DNS normál szekvenciájának megváltozását. A kromoszómális szintű egyéb mutációk magukban foglalják a kromoszómális beilleszkedéseket, inverziókat, transzlokációkat és deléciókat.
-

Kromoszómális vagy kromoszómális sokszorosítás. Udvariasság: Nemzeti Humán Génkutató Intézet, a Wikimedia Commonson keresztül
A kromoszómás duplikációk ugyanazon forráshelyen fordulhatnak elő, mint a duplikált fragmentum. Ezek a kötegelt ismétlések. A kötegelt másolatok kétféle lehetnek: közvetlen vagy fordított.
Közvetlen másolatok azok, amelyek megismételik az információt és az ismételt fragmentum tájolását. A kötegelt fordított másolatú fragmensekben az információ megismétlődik, de a fragmensek ellentétes irányba mutatnak.
Más esetekben a kromoszóma-duplikáció megtörténhet egy másik helyen vagy akár egy másik kromoszómán is. Ez létrehozza a szekvencia ektopikus másolatát, amely szubsztrátként funkcionálhat a keresztezésnél, és a rendellenes rekombinációk forrása lehet. Az érintett mérettől függően a másolatok lehetnek makro- vagy mikroduplikációk.
Evolúciós szempontból a duplikációk változékonyságot és változást generálnak. Az egyéni szinten azonban a kromoszómás megduplázódás súlyos egészségügyi problémákat okozhat.
A kromoszómás duplikációk mechanizmusa
A sokszorosítások leggyakrabban azokban a DNS-régiókban fordulnak elő, amelyek ismétlődő szekvenciákkal rendelkeznek. Ezek a rekombinációs események szubsztrátjai, még akkor is, ha a nem teljesen homológ régiók között fordulnak elő.
Ezeket a rekombinációkat illegitimnek mondják. Mechanikailag függnek a szekvencia hasonlóságtól, de genetikailag nem homológ kromoszómák között is végrehajthatók.
Az emberben többféle ismétlődő szekvencia van. A nagyon ismétlődőek közé tartozik az úgynevezett műholdas DNS, amely a centromerekre korlátozódik (és néhány heterokromatikus régióra).
Mások, közepesen ismétlődőek, például a tétel megismétli ezt a riboszomális RNS-t. Ezek az ismétlődő vagy duplikált régiók nagyon specifikus helyekben helyezkednek el, úgynevezett nucleolus szervező régióknak (NOR).
Az emberekben a NOR-ok öt különböző kromoszóma szubtelomer régióiban helyezkednek el. Minden NOR, a maga részéről, ugyanazon kódoló régió százait-ezer példányát alkotja, különböző szervezetekben.
De vannak más ismétlődő régiók, amelyek szétszórtan vannak a genomban, különböző összetételű és méretű. Mindegyik képes rekombinálni és duplikációkat válthat ki. Valójában sokuk a saját sokszorosításának eredménye, in situ vagy méhen kívüli. Ide tartoznak többek között a miniszatellitok és a mikroszatellitok.
A kromoszómális megkettőződések, ritkábban, nem homológ végek összekapcsolásával is előfordulhatnak. Ez egy nem homológ rekombinációs mechanizmus, amelyet megfigyelnek néhány DNS kettős sáv törés helyrehozási eseményében.
Kromoszómás duplikációk a gének evolúciójában
Ha egy gént ugyanazon a helyen, vagy akár egy másikban másolják, akkor szekvenciával és jelentéssel rendelkező locust hoz létre. Vagyis egy értelmes sorrend. Ha így marad, akkor a szülői gén kettős génje, és onnan származik.
De lehet, hogy nem esik ugyanolyan szelektív nyomás alá, mint a szülőgén, és mutálódhat. Ezeknek a változásoknak az összege néha új funkció megjelenéséhez vezethet. Már a gén is új gén lesz.
Az ősi globin lókusz megkettőzése például az evolúcióhoz vezetett a globin család megjelenéséhez. Az ezt követő áttelepítések és egymást követő átfedések a család növekedését eredményezték, ha az új tagok ugyanazt a funkciót látják el, de alkalmasak más körülményekre.
-

A globin géncsalád. Yuhrt, a Wikimedia Commons segítségével.
Kromoszómás duplikációk a fajok fejlődésében
Egy szervezetben egy gén megkettőződése ahhoz vezet, hogy egy párhuzamos génnek nevezett másolatot generáljunk. Egy jól megvizsgált eset a fent említett globin gének esete. Az egyik legismertebb globin a hemoglobin.
Nagyon nehéz elképzelni, hogy csak egy gén kódoló régióját lemásolják. Ezért minden paralogue-gén társult a párhuzamos régióban lévő paralogue-régióval.
Az evolúció során a kromoszómás megduplázódások különböző módon játszottak fontos szerepet. Egyrészt másolják azokat az információkat, amelyek új funkciókat eredményezhetnek, ha a géneket egy előző funkcióval helyettesítik.
Másrészt, ha a duplikációt egy másik genomi környezetbe helyezzük (például egy másik kromoszóma), eltérő szabályozással rendelkező paralogot hozhat létre. Más szavakkal, nagyobb adaptációs kapacitást képes generálni.
Végül rekombinációval létrejönnek a csererégiók is, amelyek nagy genomiális átrendeződésekhez vezetnek. Ez viszont a specifikációs események eredetét reprezentálhatja, különös tekintettel a makroevolúciós vonalokra.
A mikroduplációk által az egyénben okozott problémák
A következő generációs szekvenálási technológiák fejlődése, valamint a kromoszómafestés és a hibridizáció most új társulásokat tesz lehetővé. Ezek a társulások magukban foglalják bizonyos betegségek megnyilvánulását a genetikai információ megszerzése (megkettőzése) vagy elvesztése (törlése) miatt.
A genetikai duplikációk a géndózis megváltoztatásával és aberráns keresztezésekkel járnak. Mindenesetre a genetikai információk egyensúlyhiányához vezetnek, amely néha betegség vagy szindróma formájában nyilvánul meg.
Például az 1A típusú Charcot-Marie-Tooth szindróma a PMP22 gént tartalmazó régió mikroduplációjával jár. A szindróma az örökletes szenzoros és motoros neuropathia néven is ismert.
Vannak olyan kromoszómális fragmensek, amelyek hajlamosak ezekre a változásokra. Valójában a 22q11 régió számos alacsony példányszámú ismétlést hordoz a genom ezen részére.
Vagyis a 22. kromoszóma hosszú karjának 11. sávának régiójából. Ezek a duplikációk számos genetikai rendellenességgel társulnak, beleértve a mentális retardációt, a szem rendellenességeket, mikrocephalyt stb.
Nagyobb mértékű másolat esetén részleges triszómiák léphetnek fel, amelyek káros hatással lehetnek a szervezet egészségére.
Irodalom
- Cordovez, JA, Capasso, J., Lingao, MD, Sadagopan, KA, Spaeth, GL, Wasserman, BN, Levin, AV (2014) A 22q11.2 mikrodupláció szemészeti megnyilvánulása. Ophthalmology, 121: 392-398.
- Goodenough, UW (1984), Genetics. WB Saunders Co. Ltd, Philadelphia, PA, USA.
- Griffiths, AJF, Wessler, R., Carroll, SB, Doebley, J. (2015). Bevezetés a genetikai elemzéshez (11. kiadás). New York: WH Freeman, New York, NY, USA.
- Hardison, RC (2012) A hemoglobin és gének evolúciója. Cold Spring Harbor perspektívák az orvostudományban 12, doi: 10.1101 / cshperspect.a011627
- Weise, A., Mrasek, K., Klein, E., Mulatinho, M., Llerena Jr, JC, Hardekopf, D., Pekova, S., Bhatt, S., Kosyakova, N., Liehr, T. (2012) Mikrodeletion és mikroduplitációs szindrómák. Journal of Histochemistry & Cytochemistry 60, doi: 10.1369 / 0022155412440001


